Actualmente, uno de los principales problemas que la cuenca de Santiaguillo enfrenta es la descarga de Aguas Residuales de origen doméstico a los afluentes de la laguna, originando contaminación de los cuerpos de agua, así como del acuífero y situaciones que comprometen la salud pública. Es por eso que Pronatura Noreste en conjunto con el Comité Activo de la Cuenca de Santiaguillo (CACS AC), a través de North American Wetlands Conservation Act (NAWCA), así como con el apoyo